La mer Ionienne sépare la péninsule italienne et la Sicile à l’ouest, de l’Albanie et de la Grèce à l’est. Elle est reliée à la mer Tyrrhénienne par le détroit de Messine et à la mer Adriatique par le canal d’Otrante. 

Elle a donné leur nom aux îles Ioniennes, archipel au large de l’Albanie du Sud et de la Grèce. Cette mer comprend également le Golfe de Tarente en Italie du Sud et le Golfe de Corinthe en Grèce. 

C’est dans la mer Ionienne que se trouvent les fosses les plus profondes de la Méditerranée (la fosse Calypso, au large de la Grèce, en détient le record).